Wehr ist eine Kleinstadt im südlichen Baden-Württemberg, im Landkreis Waldshut-Tiengen gelegen. Der Ort liegt unmittelbar am Hochrhein und dessen Nebenfluss Wehra.
Im Norden der Stadt liegt der Hotzenwald, ein südlicher Ausläufer vom Schwarzwald.
Nachbargemeinden von Wehr sind Hasel und Schopfheim im Norden, Herrischried im Nordosten, Rickenbach im Osten, Bad Säckingen im Südosten, Wallbach (Schweiz) im Süden, Möhlin (Schweiz) im Südwesten und Schwörstadt im Westen.
